Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CIPCQ9C0C6 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms