Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
RFTN1Q14699 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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