Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PRKCHP24723 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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