Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TTPAP49638 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TTPAP49638 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TTPAP49638 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TTPAP49638 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms