Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SYNE4Q8N205 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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SYNE4Q8N205 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SYNE4Q8N205 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SYNE4Q8N205 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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SYNE4Q8N205 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SYNE4Q8N205 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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