Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RN7SL169P-201ENST00000485643 289 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TCEAL4-212ENST00000494801 1008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC116049.1-201ENST00000505282 385 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 IGLC5-201ENST00000519670 293 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AP005597.3-201ENST00000532369 799 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC006065.2-201ENST00000536978 211 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC020611.1-201ENST00000537101 254 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ACTN1-AS1-201ENST00000553944 484 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC013452.1-201ENST00000560630 598 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TTC39A-AS1-202ENST00000568425 554 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC010542.2-201ENST00000568560 511 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RPSAP57-201ENST00000590033 832 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SL82P-201ENST00000611435 237 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SL673P-201ENST00000616262 237 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SL628P-201ENST00000619139 237 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SL719P-201ENST00000620196 237 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 RN7SL469P-201ENST00000621501 237 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC012186.3-201ENST00000623850 485 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC092653.2-201ENST00000624373 513 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DDX41-218ENST00000625286 150 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC092329.4-205ENST00000638822 574 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FBXW12-202ENST00000415155 1370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC027613.1-202ENST00000513136 1957 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 KLF8-204ENST00000468660 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MSANTD3-TMEFF1-201ENST00000502978 2069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 FANCB-201ENST00000324138 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ANKRD39Q53RE8 TFF1-201ENST00000291527 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms