Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NCF4Q15080 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms