Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms