Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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