Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CCDC96Q2M329 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CCDC96Q2M329 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CCDC96Q2M329 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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CCDC96Q2M329 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CCDC96Q2M329 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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CCDC96Q2M329 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC96Q2M329 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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