Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NRF1Q16656 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms