Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CNGB1Q14028 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms