Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXE3Q13461 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
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FOXE3Q13461 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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