Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms