Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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HOXD10P28358 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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HOXD10P28358 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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HOXD10P28358 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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HOXD10P28358 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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HOXD10P28358 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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HOXD10P28358 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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HOXD10P28358 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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HOXD10P28358 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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