Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S3

Rasgrp1, RAS guanyl-releasing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp1Q9Z1S3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasgrp1Q9Z1S3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasgrp1Q9Z1S3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms