Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xpr1Q9Z0U0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xpr1Q9Z0U0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms