Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms