Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps29Q9QZ88 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms