Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnt3Q9QZ47 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms