Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bcl11aQ9QYE3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bcl11aQ9QYE3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms