Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx4Q9QY61 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx4Q9QY61 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms