Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma6Q9QUM9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma6Q9QUM9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms