Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk3aQ9JKX8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk3aQ9JKX8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms