Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chrac1Q9JKP8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chrac1Q9JKP8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms