Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpa33Q9JKA5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms