Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3bQ9JHJ5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3bQ9JHJ5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3bQ9JHJ5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr3bQ9JHJ5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158 ms