Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capn10Q9ESK3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn10Q9ESK3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms