Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn1Q9EPL2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms