Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhc1Q9D9T8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhc1Q9D9T8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhc1Q9D9T8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhc1Q9D9T8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhc1Q9D9T8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efhc1Q9D9T8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhc1Q9D9T8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms