Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34b2Q9D9N2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34b2Q9D9N2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34b2Q9D9N2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34b2Q9D9N2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Cldn34b2Q9D9N2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cldn34b2Q9D9N2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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