Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Capn9Q9D805 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms