Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Srp19Q9D7A6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp19Q9D7A6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp19Q9D7A6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Srp19Q9D7A6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms