Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer4f1Q9D5Q6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms