Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms