Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx11Q9D3G5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx11Q9D3G5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms