Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D1F3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms