Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms