Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih4Q9CX13 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms