Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddx28Q9CWT6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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