Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psma8Q9CWH6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma8Q9CWH6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms