Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930519P11RikQ9CUJ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms