Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms