Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm16286Q9CQX6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms