Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PompQ9CQT5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PompQ9CQT5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms