Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms