Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NepnQ9CQ76 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms