Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc4Q99PH1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms