Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GatbQ99JT1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms