Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms